Funkce Apple Time Machine je plnohodnotná zálohovací rutina, která za poslední den udržuje hodinové zálohování, denní zálohování za poslední týden a týdenní zálohování tak dlouho, dokud je místo v jednotce pro jejich uložení, a používá funkci nazvanou "hard linking" pro sdílení nezměněných dat z předchozích záložních souborů s novými soubory zkopírovanými do záloh. Tato rutina by měla zajistit, že dokonce i při poměrně malém zálohovaném disku (alespoň velikost kolektivních dat, která zálohujete), budete mít dostatek bodů obnovení systému a přístup k předchozím verzím souborů. Tímto způsobem služba Time Machine může v průběhu času udržovat rozsáhlé snímky vašeho systému.

Zálohování velkých datových sad však snižuje počet záloh, které může mít menší disk, takže pokud chcete mít k dispozici více zálohování Time Machine, nechcete zálohovat velké a nepotřebné soubory, například kopii filmu, který nechcete sledovat znovu.

Další příklady takových souborů mohou být obrázky virtuálního stroje pro programy jako VMWare Fusion nebo Parallels Desktop, které mohou být někdy o velikosti mnoha gigabajtů nebo velké stahování, které jste mohli odstranit, ale které byly zálohovány. (Chcete-li ušetřit místo na jednotce Time Machine, doporučuji vynechat složku Stahování ve vašem domovském adresáři z rutiny zálohování Time Machine.)

Dokonce i když vyloučíte soubor z Time Machine, před jeho zálohováním zůstanou i nadále, dokud je nevymažete z jednotky Time Machine.

Namísto toho, abyste ručně odstranili soubor z každé zálohy, můžete okamžitě ze služby Time Machine odstranit všechny jeho instance. Chcete-li to provést, jednoduše přejděte do umístění souboru a vyvolejte rozhraní Time Machine (provedené v nabídce Time Machine). Když se objeví zobrazení hvězdného pole služby Time Machine, najděte soubor v nejpřednějším okně, klepněte pravým tlačítkem na něj a vyberte možnost "Odstranit všechny zálohy souboru [název_souboru]" a akci potvrďte.